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Meddly Leslye Santolalla Robles

Eduardo Martin Tarazona Santos

Genética Evolutiva e de Populações Humanas

Genética de Populações em América Latina, Miscigenação e Fenótipos Complexos

 

20/12/2017

Bloco B2- Sala 162

14:00

Eduardo Tarazona Santos (UFMG)
Aristóteles Goes Neto (UFMG)
Claudia Guimaraes (EMBRAPA)
Flávia Siqueira (IFMG-Betim)
Tais Nóbrega de Sousa (FIOCRUZ)

Os latino-americanos são um mosaico de três ancestralidades diferentes. A maioria dos estudos genéticos registrados no GWAS-catalog inclui indivíduos com ascendência principalmente europeia, portanto, há uma sub-representação de latino-americanos nativos e misturados nos estudos genômicos de associação. A abordagem de Admixture Mapping é uma estratégia promissora para identificar variantes genéticas associadas à ancestralidade não europeia, que influenciam nos fenótipos complexos nas populações não-europeias misturadas, como o Brasil. No contexto do projeto EPIGEN-Brasil, realizamos o Admixture Mapping do Índice de Massa Corpórea (IMC), um traço complexo, em três populações misturadas do Brasil que apresentam características muito diferenciadas. Nas crianças de Salvador, encontramos dois SNPs na região cromossômica 10q22.3 (gene ZMIZ1) associados ao IMC, com tamanho de efeito de baixomédio. Nas jovens do sexo feminino de Pelotas, relatamos a associação sexo-específica de um SNP em uma região intergénica do 13q12.3, altamente associado com IMC. Para este SNP, muito raro nos europeus, mas que atinge frequências de 4-5% em africanos, estimamos surpreendentemente um efeito moderado com um beta de 3.90 kg/m2. Além disso, ao considerar o poder estatístico e depois de testar a associação dos SNPs previamente reportados como associados a IMC no GWAS-catalog nas nossas coortes brasileiras confirmamos a associação bem estabelecida dos SNPs rs1558902 e rs9939609 do gene FTO, somente em adultos jovens de Pelotas, que juntamente com outras análises de replicação, apoiam o conceito de que a arquitetura genética do IMC depende da idade. Portanto, demonstramos como as populações brasileiras misturadas têm o potencial de contribuir ao conhecimento da arquitetura genética global e dependente da idade do IMC e outros fenótipos complexos. Como parte de um meta-GWAS do intervalo PR realizado pelo consórcio CHARGE, realizamos um GWAS, usando dados imputados, no estudo de coorte de idosos de Bambuí. Observamos três picos importantes nos cromossomos 7, 12 e 14 nos resultados preliminares da análise de regressão que serão meta-analisados em conjunto com outros GWAS. Finalmente em um projeto em andamento, e sempre no espírito de análise da diversidade genética de genes de importância biomédica em populações latino-americanas, estamos usando NGS para caracterizar, em indivíduos de ascendência nativa americana, a 38 genes previamente identificados como diferenciados nessas populações. Procedimentos laboratoriais e pipeline de bioinformática foram criados para analisar esses dados. Até agora, a avaliação do controle de qualidade da cobertura indicou a boa qualidade das sequências e variantes. Identificamos um total de 12.802 polimorfismos de nucleotídeos únicos e 3.954 indels nos 150 indivíduos do estudo.  

América Latina, estudos de asociação , miscigenação