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Luciana Werneck Zuccherato

Eduardo Martin Tarazona Santos

Padrões de Diversidade Genética do mtDNA em populações nativas da América do Sul

Estrutura populacional e diversidade de variações em número de cópias (CNVs) de genes do sistema imune em populações nativas da América do Sul

 

28/11/2012

Sala 162 Bloco B2 ICB/UFMG

14:30

Dr. Eduardo MartinTarazona Santos - Orientador (UFMG)
Dr. Lavínia Schuler Faccini (UFRGS)
Dra Alessandra Pontillo (USP)
Dr. Tiago Magalhães (UFMG/MEDICINA)
Profa. Dra. Cláudia Teixeira Guimarães (EMBRAPA)

Regiões variáveis em número de cópias (CNVRs) são formalmente definidas como segmentos de DNA que variam de um kilobase a vários megabases de tamanho e apresentam variações em número de cópias em relação a uma sequência referência, cujo valor usual de cópias é 2. Essas regiões representam uma parte significativa da variação genética humana, onde os graus de diversidade global e os padrões de estrutura genética se assemelham ao observado em análises de polimorfismos de nucleotídeo único (Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs). Podem estar presentes em regiões genômicas que envolvem genes sensíveis a dosagem, cujos impactos funcionais são responsáveis pelas associações entre variantes de número de cópias (CNVs) raras e comuns e uma variedade de doenças genéticas complexas. No presente trabalho nos propusemos a estimar a diversidade de genes que apresentam variação de número de cópias no genoma de populações nativas, cuja amostragem é sempre sub-representada nos grandes estudos genéticos e limitada às populações disponíveis no painel comercial HGDP-CEPH. Analisamos a distribuição de frequência de CNVs multicópias do cluster de beta-defensinas, genes CCL3L1/CCL4L1, FCGR3A, FCGR3B e FCGR2C e as variantes alélicas FCGR3B-HNA1a/1b, FCGR2C-Q57X e Clado I e II do gene DEFB103, em um grande conjunto de amostras autóctones de nativos americanos peruanos das populações de Ashaninka, Monte Carmelo, Shimaa e Quéchua, utilizando o técnica de Paralogue Ratio Test. Os resultados foram comparados com dados disponíveis na literatura para se investigar a existência de distribuições diferenciais de diplótipos em nativos sul-americanos, e acrescentar novas informações sobre a diversidade genética de CNVs do continente. Os resultados mostraram que os ameríndios tendem a apresentar uma maior frequência de eventos de deleções no gene FCGR3B, um aumento da frequência do alótipo FCGR3B-HNA1a, assim como de duplicações do número de cópias da região CCL3L1/CCL4L1. Especialmente, a população Shimaa mostra uma maior frequência do diplótipo 7 cópias na região de beta-defensinas. Estes resultados representam possíveis impactos funcionais dos genes envolvidos na resposta imunológica destas populações apresentadas no contexto evolutivo da diversidade genômica global, com futuras implicações para estudos epidemiológicos de suscetibilidade a doenças autoimunes e infecciosas.